Адам Кейн (Джон Ши) — лидер, координатор и стратег Мутантов Икс (сам обычный человек). Когда-то работал над Геном Икс в качестве главного биогенетика. Очень умный человек, фактически заменяет Мутантам Икс отца. Создал особую систему, создающую в штабе команды голографическое изображение базы Экхарта (Том МакКэмус). В финальной серии раскрывается что Адам является клоном основателя тайной организации под названием Доминион.


Брендан Малврей (Виктор Вебстер) — парень, способный выпускать из рук электричество. Электрический элементал. Всегда имеет весёлое настроение, типичный бабник. В бою — очень опасный противник. Любит книги, в команду попал позже всех. После «эволюции», получил способность совершать реактивные прыжки.


Эмма Де Ларо (Лоурен Ли Смит) — очень умная девушка, помогает Адаму в лаборатории. В команде оказалась в предпоследнюю очередь. Псионик-телеэмпат. Владеет эмпатией, также способна управлять чужими чувствами. Часто выступает как мозг команды. После «эволюции», получает мощные ментальные способности, включая управление мыслями и восприятием окружающих (в одной серии, ей даже удалось заставить целую армию пройти мимо самолёта отряда). Погибает из-за Экхарта.


Джесси Килмартин (Форбс Марч) — компьютерный гений, способный изменять плотность своего тела (фазировать, как говорят его товарищи по команде). Немного странный и жестокий, но внутри добрый, чувствительный и даже романтичный. Способен становится неосязаемым как призрак, или твёрдым как скала. То есть Молекулярный Неосязаемо-Неуязвимый. «Призрачность» работает только секунд до 20-30, иначе Джесси необратимо растворится. Для увеличения плотности тела, ему необходимо задержать дыхание — этим и ограничивается способность (то есть, он возвращается к обычной плотности, когда опять начинает дышать). После «эволюции», получает способность изменять плотность других предметов (однажды ему даже удалось «фазировать» весь самолёт команды вместе с «экипажем», а в финальной серии он сделал сверхплотной всю команду).


Шалимар Фокс (Виктория Пратт) — храбрая девушка, являющаяся чем-то средним между человеком и зверем. По классификации мутантов — Дикарь, скорее всего Кошка. Обострены все чувства, сила, присутствует «животный магнетизм», она способна бегать и взбираться по отвесной стене и приземляется «на все четыре» с большой высоты. Влюблена в Бреннана. Всегда готова защитить других и всех, кого любит. После «эволюции», получает гораздо более развитые инстинкты и рефлексы. Например, по ее собственному выражению, у нее появляются «глаза на затылке».


Лекса Пирс (Карен Клише) — её способности, это быть невидимой, ослеплять соперника и выпускать лазерные лучи. После того как Эмма умирает, а Адам инсценирует свою смерть и больше года скрывает от Мутантов Икс и от своих врагов тот факт что он жив, Лекса становится членом команды «Мутанты Х». Ведёт список врагов, каждого из которых стремится уничтожить.

Элементальные — новые мутанты со способностью вбирать, выбрасывать, проецировать или управлять различными видами энергии. Существует несколько типов Элементалов, включая Электрических, Тепловых (управляющих огнём или льдом), Звуковых, Химических (выделяющих химические составы, например кислоты), Ботанических (управляющих растениями) и редких Геологических (управляющих землёй).
Дикари — новые мутанты, чья ДНК состоит из комбинации человеческой и животной, позволяя им использовать некоторые животные способности. Существует несколько типов Дикарей, включая Кошачьих, Медвежьих, Собачьих, Рептилиевых, Свиных, Бычьих, Оленьих, Земноводных, Рыбьих, Насекомообразных и Птичьих.
Молекулярные — новые мутанты способные манипулировать структурой и молекулярной плотностью своих тел. Некоторые Молекулярные обладают несколькими способностями. Молекулярные способности включают в себя Неосязаемость (способность проходить через предметы), Неуязвимость (способность увеличивать плотность и становиться неприбиваемым), Невидимость, Сверхскорость, Гравитативность (способность управлять притяжением), Хроматичность (способность управлять светом и менять свою окраску), Стазис (способность замедлять время), Репликация (способность копировать предметы), Эластичность (способность менять размер или форму тела), Телепортация (способность мгновенно перемещаться) и Регенерация (способность лечить любые раны и восстанавливать утраченные конечности).
Псионики — новые мутанты с повышенными ментальными способностями. Существует несколько типов Псиоников, включая Телепатов (читающих мысли других), Телекинетиков (двигающих предметы силой мысли), Телеэмпатов (чувствующих и управляющих эмоциями других), Телекибергов (мысленно управляющих электронными устройствами), Предвидящих (получающих видения), Иллюзионистов (создающих и проецирующих иллюзии другим), Астралов (проецирующих своё сознание), Синтезаторов боли (проецирующие боль другим) и Мульти-измерительных (создающих измерения).

Некоторые чрезвычайно редкие новые мутанты обладали способностями нескольких классификаций. Новый мутант по имени Габриэль Эшлок был самым первым и самым мощным из новых мутантов. Он обладал способностями из всех четырёх классов, из которых были показаны способность бросать сгустки энергии, сила Дикарей, Неосязаемость, Генерация силовых полей, Телепатия, Контроль разумов, Телекинез и Пси-удары.